Para efectos de organizar el trabajo sindical el actual Directorio Nacional de Aprojunji ha creado las siguientes áreas: Área de Gestión Relaciones Laborales, Área de Gestión Relaciones Externas, Área de Gestión Comunicaciones, Área de Gestión Capacitación y Formación, Área de Gestión Convenios y Beneficios.
Katherine Valle
Presidenta
Luis Daza
Tesorero
Roxana Salinas
Secretaria Nacional
George Christi
Director Nacional
Christian San Martín
Director Nacional
Silvia Cespedes
Directora Nacional
Susana Cristi
Directora Nacional
Nelly Castillo
Directora Nacional
Mariela Ortega
Directora Nacional